本发明公开了一种轨道交通车辆及其内电融合动力系统与控制方法，包括电力机车和内燃机车，电力机车每个变流器柜的输出端分别与牵引电机、辅助变压器连接；辅助变压器的输出端通过第五接触器开关与列车供电柜的输出端连接；每个列车供电柜的输出端分别与第一插座、第二插座的第一端连接；第二插座的第一端通过线缆与对应变流器柜中的其中一个四象限模块的输入端连接；在线缆上还设有线路电抗器和第一接触器开关，第一接触器线圈的得失电由挂载车厢所需电源来控制；内燃机车的辅助逆变器的输出端与所述第一插座、第二插座的第二端连接；本发明在不额外增加内燃机车的情况下，解决了无电区且大坡度情况下，单台内燃机车无法启动的问题。