本发明公开了一种装配式超高层结构施工运营全阶段的快速结构健康监测方法，包括：随工程项目施工进度的推进，逐步安装数据采集设备；采集施工进程中的结构振动数据并分析；建立随工程施工进度的结构有限元模型；根据结构实测模态参数与计算模型模态参数的差异，评估施工过程中的安全性；施工结束后根据结构整体振动数据对结构有限元模型进行修正；运营阶段定期采集结构振动数据并分析；将运营阶段的结构实测模态参数与修正后有限元模型模态参数进行对比分析。本发明能够及时监测整个工程施工过程中结构状态变化情况，实现施工过程的快速安全评估以指导实际施工，并在结构运营过程中对结构进行实时安全状态评估以及时发现结构安全隐患。