本发明公开了一种克菌丹的制备装置及方法，包括第一混合机构以及第二混合机构，所述第一混合机构包括搅拌溶解罐，所述搅拌溶解罐顶部设置有第一电机，所述第一电机的输出端配合连接有搅拌轴，所述搅拌轴贯穿所述搅拌溶解罐的顶部伸入至搅拌溶解罐的内腔，所述搅拌轴沿长度方向间隔套设有若干组搅拌叶片，不需要人工的监测搅拌溶解罐内溶液的溶解情况，大大节省了劳动力，实现了自动监测的功能，并且能够保证溶液均已经充分混合，消除掉了通过人工检测时带来的误差影响，进一步提高了克菌丹成品的质量。