本发明公开了一种多特征和模型耦合的牧畜遥感监测方法、系统及存储介质，涉及对地监测领域。具体步骤如下：采集监测数据，监测数据为监测区域内当期高分遥感影像和背景高分遥感影像；建立基于深度学习的牧畜群检测模型；通过牧畜群检测模型对监测数据进行检测，得到牧畜群分布数据；利用基于高斯拉普拉斯梯度差和面向对象的方法提取监测数据的牧畜斑点，形成牧畜斑点分布数据；用牧畜斑点分布数据对牧畜群分布数据进行校验和增强，形成增强的牧畜群监测结果，再通过人工辅助修边，形成精准的牧畜群数据及其内部所包含的牧畜斑点数据。本发明可以精准、高效掌握牧畜群的分布信息，有效监测评估了区域牧畜的资源量和区域载畜压力。