本发明提供了一种可适配WebGIS平台的格点数据可视化方法和系统，系统包括服务器端和浏览器端：服务器端压缩格点数据于单通道灰度图像中并发送到浏览器端，浏览器端生成数据纹理、色尺纹理，创建WebGL着色器程序，绘制各个像素对应的点图元，完成可视化视图渲染显示，同时提供与通用WebGIS平台适配的工作模式。本发明采用数据压缩方式一次性传输全部格点数据，提升了传输效率；渲染阶段对显示区域内每个像素点绘制一个图元，优化了显示效果。本发明提供了元素覆盖、图层嵌入两种与WebGIS平台适配的方式，为格点数据在通用WebGIS平台上的可视化提供了解决方案。