本发明提供地下车站端头井前上部含风井结构及其下穿施工方法，下穿施工方法包括以下步骤：步骤S1，对地面进行平整；步骤S2，风井外围设置围护结构；步骤S3，在围护结构范围之内进行土体加固，土体加固区域在上下方向覆盖风井开挖区域以及盾构区域；步骤S4，开挖风井结构基坑，从上自下分段分层开挖，先撑后挖，基坑开挖后立即封底；风井基坑开挖完成以后立即开始风井结构主体施工，进行基底底板处理、侧墙及顶板施工与接口施工；步骤S5，待土体加固区域达到设计强度要求后，进行地铁隧道盾构施工，盾构施工过程配合二次注浆，在管片外进行二次注浆，以确保管片壁后注浆密实。盾构穿越产生的扰动不会破坏风井结构，保护风井结构的质量。