本发明涉及一种粘弹性材料特性确定方法及系统，涉及纳米操作技术领域，首先利用AFM获取粘弹性材料样品的力学特性曲线；其次利用流体流动阻力校正力学特性曲线，获得校正曲线；然后利用校正曲线确定粘弹性材料样品的表观黏度；最后利用三维Kelvin–Voigt粘弹性模型，根据表观黏度计算粘弹性材料样品的弹性模量。本发明考虑到探针在加载过程中受到流体流动阻力的影响，通过利用流体流动阻力校正所述力学特性曲线，准确计算粘弹性材料特性，进而实现准确地表征柔性材料。另外，本发明采用三维Kelvin–Voigt粘弹性模型直接计算粘弹性材料样品的弹性模量，能够快速计算粘弹性材料样品的弹性模量。