本发明提供了基于数字孪生的海洋隔水管系统悬挂作业决策方法及系统，属于海洋油气开发技术领域，应用于由海洋环境系统、钻井平台以及隔水管系统组成的海洋隔水管耦合系统的物理实体结构，布置用于监测所述海洋隔水管耦合系统的物理实体结构的传感器组，所述决策方法包括：通过所述传感器组获得原始监测数据建立物理实体结构模型；获得实时的监测数据建立所述物理实体结构的数字孪生模型；引入钻井平台航行路径及航速、隔水管系统配置及悬挂模式，结合隔水管耦合系统数字孪生模型与极限性能参数，提出了隔水管系统的悬挂作业决策模型，基于多目标优化算法做出实时准确的悬挂作业决策，保障隔水管系统的安全高效悬挂作业。