基于机器学习的肾脏疾病自动检测的方法和系统，包括肾脏影像收集模块、肾脏影像管理模块、肾脏影像智能诊断模块和肾脏疾病分类模块，通过肾脏影像收集模块收集的带有肾脏疾病诊断标签的肾脏影像，在肾脏影像管理模块存储并更新肾脏疾病类型对应的肾脏影像，利用机器学习算法通过肾脏影像智能诊断模块推断肾脏疾病类型，肾脏疾病分类模块按照不同的肾脏疾病种类对诊断的肾脏疾病进行分类，从而实现各肾脏疾病类型的高效、精确的诊断，对于肾脏疾病的诊断和早期筛查具有重大意义。