本发明公开了一种应用于水体缺氧环境自动化监测与调控的水下围隔系统，包括浮标、控制室和围隔；控制室设置于浮标上，围隔设置于水底；围隔内设置有密封舱、加热设备、注液设备和滑轨；密封舱内设置有传感器组和阀组，控制室内设置有主控模块、升降控制装置及可控硅模块；主控模块根据环境数据产生升降控制信号、电压控制信号及注液控制信号；电压控制信号用于控制可控硅模块的输出电压大小，进一步控制加热设备的工作功率，调控围隔内的温度；升降控制装置在升降控制信号的作用下控制密封舱在围隔内上下移动。能够在水下形成低氧环境，并对低氧环境进行长期连续自动化监测与调控。