本发明公开了一种面向通用SoC的JESD204B接口缓存结构及其数据传输方法，该缓存结构包括AHB总线模块、JESD204B接口发送端、JESD204B接口接收端，JESD204B接口发送端通信连接于JESD204B接口接收端，JESD204B接口发送端包括发送端DMA模块、发送端数据转换模块、FIFO push模块、TX Buffer模块、De‑addressingFIFO pop模块、发送端数据传输模块；JESD204B接口接收端包括接收端DMA模块、接收端数据转换模块、FIFO pop模块、RX Buffer模块、addressing FIFO push模块、接收端数据传输模块。本发明通过DMA模块辅助JESD204B接口数据的存储和访问，并同时配合缓存结构进行降速和选取数据，对于JESD204B接口的高速数据，有效降低数据过载的冲击，提升数据处理速度，为面向通用SoC的JESD204B接口应用提供了一种可靠、可行且有效的数据缓存结构。