本发明公开了一种低分子量ɑ‑葡聚糖的制备方法。所述的制备方法包括以下步骤：（1）肠膜明串珠菌活化培养后以10%接种量接种到5L发酵罐内，发酵罐内事先放入含适宜营养成份、适合发酵条件的发酵液，发酵液中碳源浓度10‑30%（以蔗糖计）、氮源0.3%、初始PH:6.8‑7.0、温度25℃‑28℃，搅拌转速120r/min发酵培养20‑40小时（2）发酵5‑30小时后添加ɑ‑葡聚糖酶到发酵液中，ɑ‑葡聚糖酶的加量为：发酵液总量的万分之一～万分之五；（3）通过掌握加酶量及发酵20‑40小时精确控制发酵液中目标产物ɑ‑葡聚糖酶的分子量在10000D以内（4）反应终止后，发酵液经过板框脱色过滤，离子交换、色谱分离提纯，浓缩、干燥制得目标分子量500‑5000D的ɑ‑葡聚糖膳食纤维产品。本发明提供的方法可降低发酵反应液粘度，同时降低发酵液中高分子ɑ‑葡聚糖的浓度，促使反应可不断的朝正向进行，加快蔗糖转化速率，提高产物产量。