本发明涉及轨道交通技术领域，公开了一种轨道交通区间排水泵站，包括：第一压力排水主管，布置于左线区间隧道内；第二压力排水主管，布置于右线区间隧道内；道床集水沟，设置于道床内部，所述道床集水沟内设置有至少两个潜水泵组；至少两个潜水泵组中的一部分潜水泵组并联连接至第一压力排水主管和第二压力排水主管中的其中一个，至少两个潜水泵组中的另一部分潜水泵组并联连接且跨过左线区间隧道与右线区间隧道之间的联络通道，连接至第一压力排水主管和第二压力排水主管中的另一个。本发明可有效减低潜水泵组内各个潜水泵的流量，降低所需要的集水沟的有效容积，减小对道床结构的影响，提高整体道床横向稳定性，加强排水安全可靠性。