本发明公开一种微型海底地层主动锚定装置，包括钻进机构、驱动机构、浮力机构、防扭转机构、传动机构和电磁控制机构，该锚定装置体积小，质量轻，内设驱动机构，无需靠外部推动或距离海底地面较高距离抛载进入海底地层，其浮力机构可在抛出后确保海底锚垂直落底，自推进钻头可钻进进入海底地层，并在完成动作后反向钻出实现回收和重复使用；依靠电磁控制机构，可以实现对锚定装置“钻进态”和“支撑态”的灵活切换，通过一个驱动机构与一个电磁控制机构实现对两种作业形态的切换控制，进而实现钻进、锚定、收锚、钻出回收四种功能。