本申请提供一种计轴复位控制系统及方法，计轴复位控制系统包括：励磁电路和采集电路；所述励磁电路包括并联的第一电路分支和第二电路分支；所述第一电路分支包括串联的总直接复位开关、直接复位继电器的励磁线圈和预复位继电器的常闭接点，所述第二电路分支包括，串联的总预复位开关、所述预复位继电器的励磁线圈和所述直接复位继电器的常闭接点；所述采集电路包括所述预复位继电器的接点和所述直接复位继电器的接点，所述采集电路连接复零板卡；所述复零板卡用于基于接收到的电平信号，确定计轴复位命令，实现两种计轴复位方式之间的互斥，提高了计轴复位控制的安全性。