本发明提供了一种频变交叉耦合同轴滤波器，包括N个双枝节谐振器，双枝节谐振器包括谐振杆和安装于谐振杆顶部的加载盘，谐振杆的底部为短路面，垂直安装在滤波器腔体内壁上，加载盘本体上设置有两个加载盘枝节；第i个双枝节谐振器与第i+1个双枝节谐振器邻接，i＝1、2…N‑1，每个双枝节谐振器与其邻接的双枝节谐振器之间形成主耦合；非邻接的双枝节谐振器之间形成至少一个频变交叉耦合单元，频变交叉耦合单元包括两个非邻接的双枝节谐振器，此两个双枝节谐振器之间形成交叉耦合，同时此两个双枝节谐振器的谐振杆通过连接筋连接形成电耦合，此两个双枝节谐振器相邻的加载盘枝节之间形成磁耦合。本发明在不提高滤波器阶数的条件下提升了滤波器的频率选择性。