本发明公开了一株具有防控烟草土传青枯病的噬菌体S5，分类命名为(Bacillusphage)，于2022年5月13日保藏于广东省微生物菌种保藏中心，保藏编号为GDMCC No：62467‑B1，保藏地址为广州市先烈中路100号大院59号楼5楼；将所述的噬菌体S5应用制备防治烟草青枯病生物制剂中，利用病原菌特异性噬菌体对青枯病进行生物防治，高效裂解青枯雷尔氏菌使其死亡，室内抑菌试验显示其抑菌率达到71.5％；将噬菌体用于烟草土传青枯病防治，盆栽防病率达到68％以上，可作为用于防治烟草青枯病的微生态制剂。