本发明公开了一种桩基工程穿越封闭式溶洞层的施工方法，通过在距离溶洞顶2‑3m处开设注浆孔，使泥浆填充满溶洞，为溶洞提供支撑，保证桩基钻进过程中不发生塌孔，节约溶洞填充工序施工时间，且泥浆为流体态，大溶洞或小溶洞的填充均能适应，泥浆填充相比其他填充材料填充成本更低，可依据排气压力值变为零判断泥浆已将泥浆填充满，同时，通过在桩基孔内设置覆盖溶洞断面的密封隔离件，实现完全隔断溶洞，具有原理简单清晰，作业人员易理解的特点。本发明还公开了一种桩基工程穿越封闭式溶洞层的装置。