本发明公开了一种用于互感器二次回路接线端子的自动识别方法及系统，属于互感器二次回路检测技术领域。本发明方法，包括：将待检测端子的端子图片输入识别网络中进行检测，确定待检测端子的编号位置以及形状数据；获取矫正后的待检测端子的编号位置以及形状数据；针对所述端子图片使用数字识别接口进行数字识别，确定图片中的端子编号；根据所述端子编号，查询端子编号信息与电气信息数据库，获取查询结果，根据查询结果将所述端子图片中端子标注为待检二次回路对应的端子。本发明通过图像识别技术，实现了关口互感器二次回路接线端子的自动识别，提高了现场作业效率。