本申请涉及一种基于时间敏感网络的智能变电站的时间同步系统及方法，系统包括中央主控处理器，中央主控处理器向波导调制器发送时钟信号，中央主控处理器向光波导延时控制器发送延迟控制信号，所述波导调制器和光波导延时控制器集成在光芯片上，所述半导体激光器与光芯片连接，用以给光芯片提供光信号，所述光芯片连接到光控制装置，光控制装置连接到变压器机组的开光装置，光控制装置用以将光芯片上的光波导延时控制器的光信号转换成变压器机组的开关信号，所述变压器机组上固定安装的磁光传感器与中央主控处理器相连。本申请有效缩短了整个智能电网的启动时间，可以更为精确的同步整个网络的系统时钟。