本发明提供一种基于fNIRS脑功能图谱的动态康复评估方法和系统，该方法包括以下步骤：基于使用者的运动能力从预先存储的多个脑功能检测范式中选择与所述使用者运动能力相匹配的脑功能检测范式；获取近红外脑功能采集装置实时采集的使用者在所述相匹配的脑功能检测范式下诱发产生的脑血氧信号；基于获取的脑血氧信号，计算近红外多模式脑功能特征参数，所述多模式为激活模式和连接模式，所述参数形成多模式脑功能特征组合向量；基于得到的多模式脑功能特征组合向量，通过集成多分类方法进行脑功能特征匹配分类，得到匹配分类结果；基于获取到的匹配分类结果通过脑功能状态评估模块提供可视化的评估报告。