本申请公开了一种废气再循环系统的控制方法及装置、电子设备、存储介质，该方法应用于目标废气循环系统，其包括混合器、废气再循环模块和三通阀，三通阀的三个端口分别连接混合器、废气再循环模块和大气，混合器的另一端连接发动机的进气管，废气再循环模块的另一端连接发动机的出气管，该方法包括：实时监测目标车辆的发动机的运行状态；当监测到目标车辆的发动机停车，保持三通阀与废气再循环模块之间连接的端口处于开启状态；关闭三通阀与混合器之间连接的端口，并开启与大气连通的端口；实时监测废气再循环模块中的废气是否已排放到满足预设标准；若已排放到满足预设标准，关闭三通阀与大气连通的端口以及与废气再循环模块之间连接的端口。