本发明公开了一种基于大数据的农作物智能选育分析方法及系统，通过获取当前农田区域历史图像数据，并根据历史图像数据与大数据害虫数据进行对比分析，得到当前农田区域的害虫情况，并对农作物进行一次筛选，进一步通过分析农田区域的农作物发病情况，对农作物进行二次筛选，得到合适的优选农作物种类。另外，本发明通过将优选农作物种类与各种灌溉技术的匹配组合，得到优选农作物方案信息，从而让种植者更好地选择培育农作物，减少了因盲目选择农作物而导致农作物低产的情况，进一步实现提高种植者的经济效益。同时，本发明科学地为种植者提供了精准且适合当前农田环境的农作物种类，提高了农作物的生产效率。