本发明提供了面向不平衡数据的IgA肾病的预测分析系统，涉及数据处理分析技术领域；包括数据收集模块、数据预处理模块、数据归一化模块、模型训练模块以及模型预测模块；所述数据预处理模块，连接在数据收集模块上，对临床检查数据和病理检查数据进行预处理，构成临床数据F；数据归一化模块，连接在数据预处理模块上，将得到的IgA肾病患者的临床数据F进行数据归一化操作；模型训练模块，与所述数据归一化模块连接，用于训练面向不平衡数据的IgA肾病预测模型；模型预测模块，与模型训练模块相连接，预测临床样本的IgA肾病恶化概率；本发明的有益效果是：提高IgA肾病患者恶化概率的预测效率。