本发明公开了一种钒电池用全氟磺酸/己酮糖复合离子交换膜及其制备方法，包括：步骤S1：将全氟磺酸离子交换树脂溶于有机溶剂中得到质量百分比为5%‑35%溶液A，将己酮糖溶于同一种有机溶剂得到质量百分比为20%‑50%溶液B，混合，得到成膜溶液；步骤S2：将成膜溶液超声震荡去除溶液中的气泡；步骤S3：将去除气泡后的成膜溶液浇铸在模具中进行热处理得到热处理膜；步骤S4：将热处理膜浸泡在双氧水溶液中进行去杂质处理后，再经过硫酸溶液进行预处理，加热干燥得到钒电池用全氟磺酸/己酮糖复合离子交换膜。本发明对钒离子的穿梭具有明显的抑制作用，可提升电堆效率；复合离子交换膜中己酮糖可以提升质子传导密度，进而提升质子传导能力。