本发明公开一种电编码锁系统及其控制方法。电编码锁系统包括电编码锁和与电编码锁配套的电脑钥匙，电编码锁包括：控制电路；继电器；微动开关；以及接口模块，接口模块包括基座以及锁芯组件，锁芯组件包括锁胆、无线供电模块、第一磁钢、转耳、闭锁销、第二磁钢，电脑钥匙包括：供电线圈；霍尔元件；第一解锁杆，与解锁孔形状相适配；第三磁钢，可移动地设置在第一解锁杆内；以及授权机构，授权机构能够驱动第三磁钢在授权状态和未授权状态之间移动。根据本发明实施例的电编码锁系统，无线供电模块集成在锁胆上，在转动电脑钥匙时，无线供电模块与电脑钥匙保持同步运动，可始终保持无线供电和无线通信的稳定性和可靠性。