本发明公开了一种基于原子碰撞能量传递的飞行物体驻点热流统计方法。该方法包括：分子动力学方法模拟物体在气体环境中高速飞行过程，输出所有可能与物体前表面发生碰撞的气体原子的坐标、速度、势能信息，定义气体原子与固体表面的一次碰撞事件为：进入气固界面吸引力层(入射点)，排斥力层内转向(碰撞点)，离开吸引力层(反射点)；根据气体原子入射和反射时刻的能量，得到单次碰撞气体原子与表面之间传递的能量，遍历统计时间段内不同原子与表面的碰撞事件，得到物体飞行过程中前表面受到的驻点热流。本发明提出了一种基于气固界面原子碰撞能量传递进行驻点热流统计的方法，有利于开展各类流动中的壁面传热问题的机理研究。