本发明公开了一种基于图神经网络的安全服务功能链构建方法，包括：1)数据处理模块，在检测阶段，通过模拟的真实网络情况获取实时流量数据特征，并进行数据的标准化处理；2)嵌入层模块，由数据处理模块经过训练得到，以数据处理模块处理后的数据作为输入，将该数据所对应域名进行维度转化；3)图神经网络层模块，由嵌入层模块经过训练得到，通过对周围节点信息的聚焦，生成最优节点；4)输出层模块，通过概率分析得出最优节点的标签，从而连接各个最优节点的标签构建出一条安全服务功能链。本发明在保证构建安全服务功能链成功率的同时，有着速度快、效率高、较灵活、成本低的优势。