本申请是申请号为CN202010726669.4的分案申请。本发明提供一种RNA病毒的靶点序列，其为RNA病毒基因序列中含20～40个碱基、且与人类基因组序列相似性不低于95％的核酸序列片段，其包括SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.26所示的靶点序列。本发明还涉及构建上述靶点序列的引物组合物、与上述靶点序列相关的生物材料以及上述靶点序列的应用。本发明构建的上述序列的病毒片段具有与人基因组DNA相互作用的功能，其类似病毒miRNA，同时验证了过表达RNA病毒靶点序列对周围基因表达水平的影响，并提出上述靶点片段是RNA病毒的重要致病物质的全新概念。上述靶点序列对RNA病毒的检测及诊断、药物筛选以及开展RNA病毒引发的病症的治疗等均具有重要应用价值。