本发明公开了一种在役风电场理论净发电量的快速估算方法及系统，方法包括：获取目标风电场及其预设周边区域地形资料、风机排布位置信息、各风机的推力系数曲线和功率曲线信息以及风场资料；对风场资料进行处理得到风场时间序列数据集，对其计算得到风场特征参数；将地形资料、风机排布位置信息、各风机的推力系数曲线和功率曲线信息及风场时间序列数据集输入预设风力发电量模型计算得到净发电量模拟结果，并与风场特征参数一同送入预设机器学习算法中进行模型训练得到净发电量估算模型；将待监测风电场的风场特征参数送入净发电量估算模型得到对应风电场理论净发电量。本发明提供的风电场理论净发电量的估算方法及系统具有成本低和效率高的优势。