本发明公开一种复杂产品装配过程质量问题析因诊断方法及系统，涉及析因诊断技术领域，在复杂产品出现质量问题时，利用逆向贝叶斯网络进行逆向推理，确定造成质量问题的初步故障节点，对于每一初步故障节点，利用训练好的贝叶斯网络进行正向推理，确定由初步故障节点造成质量问题的概率，根据每一初步故障节点的概率进行析因诊断，从而通过建立训练好的贝叶斯网络和逆向贝叶斯网络，综合逆向推理和正向推理的方式对复杂产品装配过程中的质量问题进行析因诊断，诊断精度和效率高，能够良好适用于复杂产品装配过程的质量问题的析因诊断。