本发明属于藻类活性成分多不饱和脂肪酸提取制备技术领域，公开一种从钝顶螺旋藻中制备γ‑亚麻酸和亚油酸的方法，步骤如下：螺旋藻粉破壁处理，采用超声破壁的方法对螺旋藻粉进行破壁；螺旋藻油的提取，采用索氏提取法对超声破壁藻粉进行回流加热，得到螺旋藻油；游离脂肪酸的制备，通过对螺旋藻油进行皂化回流，酸化后可得游离脂肪酸。尿素包合法富集，通过对游离脂肪酸进行低温结晶、冷却结晶，抽滤后可得尿素不包合物。通过对尿素不包合物酸化、除去残留尿素可得富含γ‑亚麻酸和亚油酸的PUFAs产品。PUFAs纯度可达90～95％，PUFAs产品中γ‑亚麻酸的含量为13～14％，亚油酸含量为15～17％。