本发明公开一种飞发一体化热/能量综合管理系统能效管控优化方法，属于飞机综合一体化热/能量管理技术领域，能够在多目标进化过程中节省计算资源，提高算法的收敛性，降低决策难度，减轻决策者负担。本发明以系统燃油消耗率为优化目标，以实际工况下的制冷量、稳定裕度等需求为约束，采用基于动态参考点及加权向量的动态参考几何引导多目标粒子群算法对引气量分配、阀门开度等进行分配，得到一个飞行包线内各飞行环境下的最优动力源分配方案，提高该系统的燃油经济性。