本发明属于飞机除冰参数控制与处理技术领域，公开了一种飞机二次结冰时间裕度控制方法、系统及计算机设备。该方法通过采集气象参数和飞机一次除冰参数，测试飞机表面粗糙度相关数据，计算机身表面残留除冰液浓度；计算具有除冰液残留的机身表面结冰初始阶段冰核临界半径和冰相界面自由能；计算壁面冰核成核率和冰核生长速率；计算机身表面近壁空间内冰晶覆盖率和二次结冰时间裕度。本发明所述控制方法具有成本低、实施易、抗干扰能力强等特点，可以做到预测飞机整机二次结冰时间裕度和结冰时间点，为调度指挥部门提供科学、准确的参考，可以有效提升航班起降效率。