本发明公开了一种基于热点温度预测的变压器冷却器组控制方法及系统，通过变压器的实验参数和额定参数计算变压器的平均油温升和传热热阻；然后利用实时获取所述变压器运行过程中当前环境温度、当前电流、当前顶油温升和当前底油温升；根据平均油温升、传热热阻、当前环境温度、当前电流、当前顶油温升和当前底油温升计算当前负载系数、当前负载损耗、当前空载损耗、当前平均油温升、当前绕组平均温升、当前热点温度和当前热点温度变化率；本发明相较于以往的控制方法和系统具有一定的优势，能够实现变压器内部油纸绝缘寿命的精准管控，有助于变压器的安全可靠运行，具有良好的现场应用效果和经济价值。