本发明实施例公开轮枝镰孢菌菌株AQFv(FB2‑)及其应用。轮枝镰孢菌(Fusarium Verticillioides)AQFv(FB2‑)，其保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏编号为CGMCC No.40153。该菌株为伏马毒素合成基因部分突变株，伏马毒素产物中95％以上为伏马毒素B3，其他为伏马毒素B1，无伏马毒素B2检出；副产物少，易于纯化，伏马毒素B3产量约为一般产毒菌株的50倍，可提高伏马毒素B3纯品的制备效率。