本发明公开了一种区域综合能源系统的多目标规划方法及系统，方法包括：获取区域综合能源系统中各个历史场景的历史场景特征因子，并对历史场景特征因子进行标准化处理；获取区域综合能源系统中的实时数据，并计算实时数据中包含的场景特征因子与各个历史场景的历史场景特征因子之间的局部相似度；计算实时数据与各个历史场景的结构相似度；筛选出大于相似度阈值的至少一个全局相似度，并将至少一个全局相似度对应的历史场景的能源结构传递至预设的多目标规划模型中进行分析，得到能源结构中各个设备的最优容量。通过选出相似度高的场景能更好地确定区域综合能源系统的能源结构。