本发明公开了一种永磁同步电机定子电阻在线识别方法及系统，属于定子电阻辨识技术领域，首先对永磁同步电机定子回路相电压和相电流进行采样，建立电机定子回路动态方程组，在电机转速稳态下构建定子回路静态焦耳热损耗模型，根据离散化的广义稳态最小均方误差算法得到离散化状态转移矩阵，进而得到定子电阻估计过程的收敛时间，根据收敛时间设计能保证辨识过程固定时间收敛的系数矩阵自适应律，根据系数矩阵自适应律并结合广义稳态最小均方误差算法进行定子电阻辨识，本发明通过整定系数矩阵自适应律，并将固有时间收敛理论融合进电阻在线辨识方案中，整体辨识算法结构简单，显著提高了电机矢量控制系统的动态性能。