本发明公开了一种大型氨动力集装箱船的燃料舱及冷能利用系统，该系统包括货舱纵向舱壁、A冷舱、B冷舱、C冷舱、燃料舱、舱口盖、保温层、燃料舱凹槽、风机、滑轨、移动隔热装置。氨燃料在集装箱船上需要较大的储存空间，而设置氨燃料舱势必会影响集装箱船的载箱量。本发明合理利用集装箱船绑扎桥下方货舱之间的隔离空间和双层壳之间的空舱作为船舶的氨燃料舱，并通过合理的设计使氨燃料舱将冷舱包围，在不影响载箱量的前提下，能够解决氨燃料在集装箱船上的储存空间大的难题，而且合理利用氨燃料的低品位冷能对冷舱内的冷藏集装箱进行制冷，冷藏集装箱的制冷机组无须运行，解决了大型集装箱船因冷藏集装箱制冷造成的船舶电网负荷高的问题。