本发明公开了一种船舶轴系台阶位的刮削系统及刮削方法，其中船舶轴系台阶位的刮削系统，包括：镗杆，能部分插入船舶待刮削区域；两个镗杆支撑组件，套设在镗杆上并能分别抵接在船体结构上以支撑并锁定镗杆的位置；刀架装置，能传动套设在镗杆上并位于两个镗杆支撑组件之间，刀架装置的一端可拆卸连接有刮削刀；轴向进给箱，连接在镗杆的一端以能调整镗杆沿轴向的位置；动力输入箱，套设在镗杆上并与镗杆传动连接以能利用镗杆上的轴向传动丝杆调整刮削刀的位置并驱动其对目标位置进行刮削。本发明代替人工手工修磨刮削刀具、及刮削台阶位的作业，减轻了劳动强度、提高了效率、提高了台阶位的垂直度精度，有效地降低了质量风险。