本发明公开了一种基于声纹数据的牛只发情状态鉴别与个体身份识别方法，涉及生物识别技术领域。包括以下步骤：S1、确定采集的牛只种群及地点；S2、确定采集设备的选择；S3、通过采集标准进行数据采集；S4、对牛只发情状态声音进行鉴定、裁剪、剔除来构建数据集；S5、进行数据增强与scp混合音频数据集构建；S6、设计全卷积时域音频分离网络与音频分类网络的拼接网络进行训练得到模型；S7、模型评估和测试；S8、构建牛只身份声纹数据库；S9、基于声纹数据库通过模型进行牛只状态和身份识别。本发明可减少大量人力，提高监测精度和范围，使其运用于大规模的养殖场景，为肉牛养殖繁育工作提供强大助力。