本申请提供了一种隧道三维模型生成方法、生成系统及存储介质，生成方法包括：获取隧道施工图，隧道施工图包括隧道线路曲线数据和隧道断面设计图数据；根据隧道线路曲线数据，解析完整链路下的线路平曲线、竖曲线、断链表数据，并融合生成含断链情况下的全里程实际线路曲线点云；根据隧道断面设计图数据，解析断面轮廓线数据和围岩等级映射表，并生成不同围岩等级标记下的隧道开挖、初支、二衬隧道断面轮廓点云；基于隧道线路里程、坐标信息，结合围岩等级映射表，对隧道断面轮廓点云与全里程实际线路曲线点云进行融合，生成实际里程下隧道线路三维点云模型。本申请对隧道设计参数需求量小，能够针对不同隧道施工标段的实际情况进行三维建模。