本发明涉及海水提升技术领域，公开了一种导轨式海水提升系统的安装方法，导轨式海水提升系统用于海上风力发电机组，包括：对取水管进行分段组装，将取水管的端部与潜水泵连接，获取分段的桩腿，将取水管、潜水泵和桩腿移动到安装区域；在操作平台上对钢丝绳绞车、电缆绞车、机械支撑装置、绞车控制箱及潜水泵控制箱进行定位安装，在固桩架上对钢丝绳导向装置及电缆导向装置进行定位安装；将具有围井区域的船舶移动到船坞中，将桩靴搭载到围井区域底部，固桩架安装在船舶上，到达安装区域后，通过钢丝绳导向装置对桩腿进行吊装，使桩腿沿围井区域向下与桩靴定位对接。本发明的导轨式海水提升系统的安装方法提高了建造效率和安装可靠性。