本申请实施例提供一种肺癌DNA甲基化标志物的筛选方法，包括以下步骤：S10，获取DNA甲基化测序数据；S20，对获取的DNA甲基化测序数据进行预处理；S30，在预处理后的DNA甲基化测序数据中对肿瘤细胞在肿瘤样本中的占比进行计算，过滤肿瘤细胞占比＜15％的肿瘤样本；S40，对肿瘤细胞占比＜15％的肿瘤样本进行过滤后，初步筛选差异甲基化位点及差异甲基化区域；S50，对初步筛选得到的每个差异甲基化位点和每个差异甲基化区域的重要性分数均进行计算，得到候选甲基化标志物；S60，对候选甲基化标志物进行优化和组合，得到肺癌DNA甲基化标志物；具有高灵敏度和特异性、经济有效、简单安全的有益效果；适用于生信分析和分子诊断的技术领域。