本发明公开了一种大直径管桩柱套沉箱复合深水基础，涉及。包括沉箱，其包括底板、顶板和外壁板；至少一个孔洞，其竖直贯设于底板和顶板上；大直径管桩柱，其设置于孔洞内部。本发明将沉箱上的孔洞套入大直径管桩柱的顶部，并沿着大直径管桩柱的外壁进行下放，因沉箱的孔洞套设于大直径管桩柱上，因此沉箱不会因水流力和波浪力发生水平方向的位移，从而减小沉箱在海中定位、纠偏和控制难度，因此提高了沉井基础下放的精准性；且大直径管桩柱与沉箱形成整体共同受力，可充分发挥大直径管桩、沉箱各自的优势。