本发明涉及幽门螺杆菌治疗药物领域，具体涉及治疗幽门螺杆菌的复方制剂胶囊及其制备方法。本发明包括阿莫西林利福布汀微片和奥美拉唑镁肠溶微片，阿莫西林利福布汀微片包括阿莫西林250~330份、利福布汀9~15份、预胶化淀粉10~25份、粘合剂6~18份、润滑剂1~6份；奥美拉唑镁肠溶微片包括奥美拉唑镁7~13份、甘露醇70~90份、预胶化淀粉70~90份、粘合剂5~15份、崩解剂5~15份、十二烷基硫酸钠3~6份、碱化剂5~10份、润滑剂2~5份。本发明解决了微片药物原料含量不足和均匀度低的问题，显著提高了所述复方制剂胶囊的质量，所述制备方法操作简单，工艺稳定，易于放大转化生产。