本发明公开了一种根据液货舱压力自动调整双燃料发动机负荷的方法及系统，发明根据液货舱当前压力和双燃料主机当前转速计算出自然挥发气当前实际消耗量与自然挥发气挥发量之间的偏差值，并通过气体热值和双燃料发动机气体模式下的效率曲线计算出双燃料主机转速调整偏移量，根据双燃料主机转速调整偏移量调整双燃料主机的转速，从而使液货舱的舱内压力稳定在安全范围内，可实现船舶航行中液货舱压力的稳定可靠、液货舱自然蒸发气的经济高效利用，使双燃料发动机完全100％的利用自然蒸发天然气，无需消耗燃油或强制蒸发天然气，使动力系统能够更加合理和高效利用所述液货舱蒸发气，极大地提高船舶的运行经济性。