本发明公开了一种基于星载嵌入式处理器的空间目标探测方法，包括快速配准、目标检测、目标轨迹关联三部分；通过粗配准和精细配准的级联式配准方法消除误差；同时采用能量响应性和能量集中性作为目标筛选判据，利用二进制映射图记录疑似目标信息，降低计算量提升计算效率；同时采用栈空间内插值筛选方法代替排序，降低了存储资源消耗；采用两帧搜索、三帧疑似、四帧确认的方式进行关联计算；同时对疑似轨迹和真实轨迹记录置信度，根据关联情况进行置信调整，实现断点续接和目标丢失的判定；本发明能够解决星载空间目标探测数据处理问题。