基于Python提取产物、团簇和化学键信息的ReaxFF后处理方法
摘要:
本发明公开了一种基于Python提取产物、团簇和化学键信息的ReaxFF后处理方法,属于反应分子动力学技术领域,该方法包括以下步骤:从ReaxFF力场获取包含产物分子信息的species源文件和原子键级信息的bonds文件;基于Python将产物、团簇以及化学键信息提取整合成含标题和对应数量的列表;在整合文件的基础上进一步筛选和排列;获得产物分子/团簇分析/化学键可分析处理的有效数据信息。本发明的方法具有高效性和便捷性,能够迅速处理反应分子动力学模拟产生的数据文件,从繁杂的数据文件中提取出有效的数据信息。此外,该方法能够对模拟的多种产物、团簇以及化学键随时间的变化情况进行数据提取。
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