本发明涉及数据处理技术领域，公开了一种燃料电池汽车的故障预测方法、设备和存储介质。该方法通过获取待预测车辆在当前时刻以及当前时刻之前的设定时间段内产生的车辆运行数据，将其输入至预先训练的与各个故障类别对应的分类器中，得到各个故障类别关联的故障数据，进而将各个故障类别关联的故障数据输入至故障预测模型中，得到针对各个故障类别的预测结果，实现对燃料电池汽车的安全性故障、动力性故障、传感器故障和非驾驶性能故障的风险实时预测，解决现有技术中发现燃料电池汽车故障的实时性差的问题，保证车辆的行驶安全，尽量在故障前预测出故障风险，避免用户频繁更换燃料电池，节省成本。